Для компиляции Kiwix нужно много открытых библиотек. Если он не компилируется, то скорей всего причиной является отсутствие одной из этих библиотек. Смотрите подробнее журнал компиляции в файле config.log. Некоторые библиотеки, без которых невозможна компиляция.